Nueva perspectiva en la microbiota pulmonar de la fibrosis quística

Por primera vez, los investigadores han encontrado la presencia de bacterias depredadoras en la microbiota de pacientes con fibrosis quística. Hay investigadores de la UPM entre los autores de este hallazgo.

Los resultados, obtenidos por un equipo de investigadores del  Hospital Universitario Ramón y Cajal , el Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria ( IRYCIS ) y la Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agraria, Alimentaria y de Biosistemas ( ETSIAAB ) de la Universidad Politécnica de Madrid ( UPM ), les han permitido diseñar un modelo computacional para erradicar los patógenos de la fibrosis quística pulmonar mediante la inoculación de bacterias depredadoras. Los resultados se han publicado en mBio®, una revista de acceso abierto de la Sociedad Americana de Microbiología.

La nueva técnica de secuenciación de próxima generación (NGS) evidencia la complejidad en la microbiota pulmonar, y además permite identificar un gran número de bacterias desconocidas hasta el momento en pacientes con fibrosis quística pulmonar.

Complex System  han participado en este estudio que ha utilizado herramientas NGS para monitorizar las fluctuaciones de este ecosistema en 15 pacientes con fibrosis quística durante un periodo de seguimiento de 1 año, describiendo por primera vez la presencia de dos depredadores bacterias en el microbioma pulmonar de fibrosis quística:  Bdellovibrio y  Vampirovibrio .

Estas bacterias depredadoras han llevado a desarrollar un modelo computacional basado en agentes donde se reproduce el comportamiento de la presa y del depredador. El modelo presenta inicialmente 500 agentes con cinco especies diferentes: dos especies con funciones de depredador y tres especies con funciones de presa. Variando la cantidad inicial de depredadores conseguimos las soluciones clásicas de los modelos tipo  Lotka-Volterra  : o la extinción total de todas las especies o la coexistencia de una especie depredadora y otra presa.

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Según Javier Galeano, investigador involucrado en este estudio, dice: “El modelo computacional recientemente diseñado nos permite plantear la hipótesis de que la inoculación de depredadores en el microbioma pulmonar podría contribuir al control de la colonización crónica por patógenos de fibrosis quística en etapas tempranas de colonización”.

de Dios Caballero J, Vida R, Cobo M, Maíz L, Suárez L, Galeano J, Baquero F, Cantón R, del Campo R, Grupo de Estudio GEIFQ. 2017.  Patrones individuales de complejidad en la microbiota pulmonar de la fibrosis quística, incluidas las bacterias depredadoras, durante un período de 1 año . mBio vol. 8, núm. 5 de septiembre

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